國際慰安婦歷史問題研究中心是圍繞慰安婦歷史研究、史料保存、公共教育和國際交流開展工作的非營利、公益性國際網絡協作平臺。中心不設固定實體辦公機構，不設地域性分支，以官方網站爲主要工作平臺，通過互聯網連接不同國家和地區的研究者、專家學者、編輯、翻譯人員、法律專業人士和志願者，共同開展史料徵集、研究整理、數字保存、公共傳播和國際合作。
一、組織性質
中心屬於開放式公共歷史、學術研究和國際協作網絡，不屬於商業機構、政府機構或政黨組織，不以營利或向參與人員分配利益爲目的。
中心實行跨地域網絡協作，在不同國家和地區開展會議、研究、出版、數據處理、接受資助及其他活動時，遵守相關活動所在地適用的法律法規。依法需要登記、備案、許可或由合法主體承接的事項，按照所在地法律辦理。
二、運作方式
中心以官方網站作爲日常工作、成果發佈和公共傳播的主要載體。網站設編輯部，負責欄目策劃、稿件編審、史料整理、翻譯校對、事實覈驗、數字出版、專題策劃、網站內容維護和對外投稿聯絡。
中心實行輕量化網絡運行機制，根據工作需要設置主任、執行協調人、主編、編輯和項目負責人，並邀請相關領域專家擔任學術顧問、法律顧問。圍繞具體研究和公共項目，可組成史料、研究、翻譯、法律、國際聯絡、技術等專項工作組，項目完成後相應工作組結束。
三、參與人員
中心主要依靠志願者和專業人士共同參與。參與人員包括歷史學者、大學教師、研究人員、檔案工作者、法律專業人士、記者編輯、翻譯人員、技術人員、學生以及關心慰安婦歷史、戰爭受害者權益和和平教育的社會人士。
參與人員可通過提供史料、開展研究、翻譯文獻、參與編輯、維護網站、開展口述歷史、組織學術活動、協助國際聯絡、提供專業諮詢等方式參與中心工作。中心原則上不收取強制會費。
四、維護及運營資金
中心日常運營費用主要由發起人、合作夥伴和志願者共同承擔，也可接受社會人士、公益機構和合作單位自願提供的贊助及項目支持。
網站服務器、域名、技術維護、史料數字化、翻譯、出版、會議、國際交流等費用，可由發起人、合作方或具體項目承擔。涉及公開募資、社會捐贈、大額資金或需要正式財務處理的項目，由依法設立或具有相應資格的合作主體承接並管理。
任何贊助不得附加幹預歷史事實、改變研究結論、限制資料公開或影響學術獨立性的條件。
五、資產管理
中心現階段不以獨立法人實體方式集中持有資產。網站服務器、電腦設備、檔案載體及其他有形資產，按照實際出資、購買憑證、協議和適用法律明確權利歸屬。
由發起人、合作方或個人購置並提供中心使用的資產，應建立登記記錄，明確所有人、保管人和使用範圍。明確捐贈用於中心公益工作的資產，不得被個人擅自轉移、處分或用於與中心宗旨無關的事項。
網站域名、網站賬號、服務器後臺、數據庫及重要數字資料實行登記、授權和交接管理，由經授權的負責人或合法承載主體負責管理。
六、知識產權
中心實行“原權利歸原權利人、使用權依授權確定”的知識產權原則。
研究人員撰寫的文章、攝影者拍攝的照片、檔案持有人提供的史料、受訪者形成的口述資料，其著作權及相關權利按照適用法律和授權約定確定，不因向中心投稿、提供資料或參與項目而當然轉移。
中心按照授權範圍對相關資料進行數字保存、編輯、翻譯、網站發佈和公益傳播。涉及版權轉讓、長期使用、獨家使用或商業出版的事項，通過書面協議另行明確。
由編輯部組織製作的網站專題、數據庫、視覺設計、數字出版物及其他成果，根據實際參與人員、委託關係和項目協議確定知識產權及使用權限。
七、資料和隱私保護
中心對慰安婦倖存者、受害者家屬及其他歷史見證人的個人信息和敏感史料實行保護。未經本人或合法權利人授權，不公開敏感身份資料、家庭隱私、聯繫方式、未公開證言及其他可能造成二次傷害的信息。
涉及口述歷史、照片、錄音錄像、證言和個人資料的採集、保存、使用和傳播，按照授權範圍及相關法律規定進行。重要歷史事實、爭議性史料和涉及法律問題的內容，經必要的事實覈驗和專業審覈後發佈。
國際慰安婦歷史問題研究中心通過長期、開放、專業的國際網絡協作，持續開展史料保存、歷史研究、數字出版、公共教育和國際交流，推動慰安婦歷史及相關戰爭受害史料得到系統保存、研究和傳播。